CPanel incluye soporte en su instalador para eAccelerator, pero por alguna extraña razón, las últimas instalaciones en las que estuve trabajando, carecen de soporte para APC (Alternative PHP Cache). Así que si por algún motivo preferimos APC por sobre eAccelerator vamos a tener que arrancar desde la consola con un poquito (casi nada) de maña.

Los pasos para instalar son más que simples
cd /usr/local/src
wget http://pecl.php.net/get/APC-3.1.9.tgz
tar -zxvf APC-3.1.9.tgz
cd APC-3.1.9
phpize
./configure --enable-apc --enable-apc-mmap --with-apxs --with-php-config=/usr/local/bin/php-config
make
make install

Habilitamos el soporte para APC agregando en el archivo de configuración de PHP (php.ini)

extension="apc.so"
apc.enabled=1
apc.shm_segments=1
apc.shm_size=128

Para terminar con la instalación, deberiamos reiniciar el servidor web que estemos usando (Apache, Lighttpd, etc). Ante cualquier duda, se puede llamar a la función phpinfo() para consultar el estado de los modulos cargados